Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms