Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms