Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms