Protein–RNA interactions for Protein: Q6TXD4

Dnmbp, Dynamin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DnmbpQ6TXD4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DnmbpQ6TXD4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DnmbpQ6TXD4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DnmbpQ6TXD4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DnmbpQ6TXD4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DnmbpQ6TXD4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DnmbpQ6TXD4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DnmbpQ6TXD4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DnmbpQ6TXD4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DnmbpQ6TXD4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DnmbpQ6TXD4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DnmbpQ6TXD4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DnmbpQ6TXD4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DnmbpQ6TXD4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DnmbpQ6TXD4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms