Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms