Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ptx4Q6RUU0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ptx4Q6RUU0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ptx4Q6RUU0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ptx4Q6RUU0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ptx4Q6RUU0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Ptx4Q6RUU0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Ptx4Q6RUU0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ptx4Q6RUU0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms