Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms