Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A8

Bckdhb, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhbQ6P3A8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BckdhbQ6P3A8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdhbQ6P3A8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms