Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms