Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms