Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac4Q6NZM9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac4Q6NZM9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac4Q6NZM9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac4Q6NZM9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac4Q6NZM9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac4Q6NZM9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac4Q6NZM9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac4Q6NZM9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac4Q6NZM9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac4Q6NZM9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac4Q6NZM9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac4Q6NZM9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac4Q6NZM9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac4Q6NZM9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac4Q6NZM9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac4Q6NZM9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac4Q6NZM9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac4Q6NZM9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms