Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
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Soga3Q6NZL0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Soga3Q6NZL0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Soga3Q6NZL0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Soga3Q6NZL0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Soga3Q6NZL0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Soga3Q6NZL0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Soga3Q6NZL0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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