Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms