Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rcbtb1Q6NXM2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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