Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms