Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SphkapQ6NSW3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SphkapQ6NSW3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SphkapQ6NSW3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SphkapQ6NSW3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SphkapQ6NSW3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SphkapQ6NSW3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SphkapQ6NSW3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SphkapQ6NSW3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SphkapQ6NSW3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SphkapQ6NSW3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SphkapQ6NSW3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SphkapQ6NSW3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SphkapQ6NSW3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms