Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo41Q6NS60 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms