Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc66Q6NS45 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms