Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt87Q6IMF0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms