Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms