Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thsd7aQ69ZU6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms