Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp9bQ66X22 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp9bQ66X22 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms