Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tpgs2Q66JT5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpgs2Q66JT5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms