Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms