Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pan3Q640Q5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms