Protein–RNA interactions for Protein: Q63959

Kcnc3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc3Q63959 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms