Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf260Q62513 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms