Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms