Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa13Q62424 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa13Q62424 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa13Q62424 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa13Q62424 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa13Q62424 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa13Q62424 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa13Q62424 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa13Q62424 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa13Q62424 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa13Q62424 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa13Q62424 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa13Q62424 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa13Q62424 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa13Q62424 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa13Q62424 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa13Q62424 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa13Q62424 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms