Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpd52Q62393 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpd52Q62393 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpd52Q62393 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms