Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms