Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rbm38Q62176 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rbm38Q62176 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rbm38Q62176 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rbm38Q62176 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rbm38Q62176 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rbm38Q62176 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rbm38Q62176 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rbm38Q62176 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Rbm38Q62176 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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