Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprrQ62132 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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PtprrQ62132 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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PtprrQ62132 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms