Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Odf1Q61999 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Odf1Q61999 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Odf1Q61999 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Odf1Q61999 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Odf1Q61999 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Odf1Q61999 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Odf1Q61999 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Odf1Q61999 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Odf1Q61999 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Odf1Q61999 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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