Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pcbp2Q61990 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms