Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms