Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms