Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf1Q61069 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf1Q61069 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usf1Q61069 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usf1Q61069 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usf1Q61069 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usf1Q61069 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usf1Q61069 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usf1Q61069 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usf1Q61069 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usf1Q61069 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usf1Q61069 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usf1Q61069 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usf1Q61069 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usf1Q61069 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usf1Q61069 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms