Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms