Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms