Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Csnk2a1Q60737 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Csnk2a1Q60737 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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