Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms