Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms