Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms