Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms