Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms