Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms