Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sco1Q5SUC9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sco1Q5SUC9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sco1Q5SUC9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sco1Q5SUC9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sco1Q5SUC9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sco1Q5SUC9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sco1Q5SUC9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sco1Q5SUC9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sco1Q5SUC9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Sco1Q5SUC9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Sco1Q5SUC9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Sco1Q5SUC9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Sco1Q5SUC9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms