Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms