Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sun3Q5SS91 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sun3Q5SS91 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms